「轩辕剑参外传.天之痕」故事,发生在「轩辕剑参」之前一百五十年前的中国,时代是中国的隋朝。陈国遗民悲痛祖国亡灭,在公元六○一年,集结了数万兵马,兴兵反抗,意图复兴故国。隋文帝立即下令平乱,然而让陈国反抗军讶异的是:朝廷的平乱部队竟然只有二十人不到之兵马,而为首之人,竟是一位年仅十岁之少年!这位身披斗篷的神秘少年,以一把神秘的「黄金之剑」,在仅仅一击之间便将数万陈国反抗军马一瞬消灭殆尽、灰飞烟灭。神秘少年与天下无敌之黄金剑「轩辕剑」威名,自此令所有人闻之色变,再也没人敢起兵反叛朝廷。 十六年后,隋炀帝时代,男主角「陈靖仇」奉师父之命,踏上寻找传说中五样中原上古神器之旅。陈靖仇是陈国后裔,在襁褓时代隋朝四处搜捕陈国遗族时,他的师父陈辅牺牲了自己的孙儿,冒险将陈靖仇替代救出。陈辅将自己复国的愿望,全落在幼小的陈靖仇身上(陈靖仇之名,即是「靖北虏,复国仇」的意思)。由于十六年前历经那场惊心动魄之噩梦,师父深知自己绝对无法敌过那位手持轩辕剑的神秘少年,所以决心改换方式,开始四处寻找传说中能让人获得天下之五样上古神器:伏羲琴、神农鼎、崆峒印、崑崙镜、女娲石,打算收齐它们,以它们的力量来复兴故国。一场艰辛的复国之旅,逐页展开。